واحد نرم‌افزار شرکت عامل سیستم در سال 1384 با هدف ارائه نرم‌افزارهای تخصصی و حرفه‌ای وب و ویندوز فعالیت خود را آغاز نمود. ارائه خدمات آموزش،‌ استقرار و پشتیبانی راهکارهای نرم‌افزاری،‌ توانمندسازی سازمان‌ها در بهبود و بهینه‌سازی فرآیندهای کسب‌وکار از مهم‌ترین اهداف و مأموریت‌های این واحد از شرکت می‌باشد.

محصولات واحد نرم‌افزار
1-نرم‌افزار مدیریت مالی – اعتباری سازمان‌ها
2-نرم‌افزار حسابداری حقوق و دستمزد
3-نرم‌افزار یکپارچه مدیریت مالی – اداری خزانه‌های معین استان‌ها
4-طراحی و پیاده‌سازی پورتال‌های سازمانی مبتنی بر CMS
5-تولید و پشتیبانی سیستم‌های مدیریت ارتباط با شهروندان (شهرداری‌ها)
6-مدیریت ارتباط با مشتریان (شرکت گاز)
7-مدیریت مکاتبات شورای شهر
8-تولید نرم‌افزار مدیریت تجهیزات سخت‌افزاری و درخواست‌های کاربران
9-نرم‌افزار دریافت آنلاین فیش حقوقی و مدیریت درخواست‌های پرسنل
10- نرم‌افزار فروشگاه‌ساز سفارش غذای آنلاین (کانادا)
11- نرم‌افزار یکپارچه مدیریت املاک و برگزاری مزایده (کانادا)
12-نرم‌افزار آموزش دیکته زبان انگلیسی (کانادا)